https://science.sciencemag.org/content/371/6524/9

В начале декабря ученые обратили внимание на необычный всплеск случаев заражения Covid–19 в Великобритании, в районе графства Кент. Данные секвенирования показали, что такое неожиданное увеличение количества заражений связано с тем, что новый штамм вируса под названием B.1.1.7 несет в себе множество опасных мутаций. О происхождении нового штамма пока ничего не известно. Понятно, что мы можем руководствоваться лишь небольшим количеством данных и делать выводы еще преждевременно. Но, тем не менее, уже на первом этапе можно сказать несколько важных вещей, на которые нужно обратить внимание.

1. Исследователи предполагают, что вирус мог развиться в крови пациента с иммуносупрессией. Этот пациент мог быть заражен в течении нескольких месяцев. За это время вирус Covid–19 в его организме мог мутировать несколько раз. И всё это время он мог заражать других людей. В результате мог возникнуть новый штамм, который несёт в себе значительно большую опасность для человека.

2. На сегодняшний день, нет данных о том, что B 1.1.7 может вызывать более тяжелые случаи заболевания или, что он увеличивает вероятность повторного заражения. Кроме того, пока нет свидетельств о том, что новый штамм может сделать вакцинированные менее эффективным.

3. Постепенно приходит всё больше доказательств тезиса о том, что B.1.1.7 является гораздо более трансмиссивным штаммом вируса чем первоначальные штаммы SARS–CoV–2. Он распространяется значительно быстрее и имеет потенциал поражать организм большего количества людей. Это может иметь огромные последствия для течения пандемии.

4. Продолжающееся крайне быстрое распространение B.1.1.7 в Великобритании (на 50% быстрее и больше чем в предыдущие месяцы) указывает на то, что этот процесс не может быть связан c эффектом основателя (процессом, при котором вирус, приходя на новое место, начинает свое бесконтрольное распространение в виду отсутствия конкурентов) или с другими нейтральными эффектами.
Крайне быстрый рост количества заражений впервые наблюдался на юго–востоке Великобритании. Позже аналогичные модели роста были зафиксирован в Лондоне, на востоке страны, а теперь и в целом по всей стране. Похожие данные приходят и из Дании. Случаи систематического заражения новым штаммом установлены во многих других странах.

5. Новые данные убедительно свидетельствуют о том, что B.1.1.7 распространяется значительно быстрее предыдущих штаммом. Однако, оценки быстроты заражений разнятся. По разным оценкам отчётов в Великобритании к базовому репродуктивному числу R можно добавить от 0.36 до 0.68. Исходя из этих данных, мы можем предположить, что R (заразность вируса) увеличивается в среднем на 0.52 (около 50%).
Что означает такое увеличение R и почему оно опаснее, чем увеличение индекса фатальности (отношение количества смертей инфицированных к количеству исходов, то есть общей сумме числа выздоровевших и умерших)?

Для этого я приведу два примера. Допустим, что в сравнительно большом городе наш R=1.1, риск фатальности = 0.8%, а инкубационный период равен 6 дням, количество инфицированных на данный момент = 10.000. :
>>> Как изменится количество случаев летального исхода через месяц? Через месяц мы получим 10000 x 1.1^5 x 0.8% = 129 новых случаев летального исхода.
>>> Теперь мы увеличим риск фатальности на 50%. Через месяц мы получим 10000 x 1.1^5 x (0.8% x 1.5) = 193 новых случаев летального исхода. То есть на 64 смерти больше чем в предыдущем случае.
>>> А теперь мы увеличим заразность (оставив риск фатальности прежним) на 50%. Через месяц мы получим 10000 x (1.1 x 1.5)^5 x 0.8% = 978 новых смертей. То есть на 849 смертей больше чем в первом случае! Количество случаев увеличится в 6.5 раз!

Такую разницу можно объяснить так: увеличение параметра, который растет экспоненциально (заразность R) может иметь гораздо больший эффект, чем аналогичное пропорциональное увеличение чего–то, что просто масштабирует результат (риск фатальности). Или другими словами: маленький процент от большого числа может быть намного больше, чем большой процент от маленького числа.

6. Что это означает для дальнейшего развития пандемии? До сих пор страны сокращали число новых случаев путем наложения ограничений и запретов таких как социальная дистанция, маски, запрет больших скоплений людей, удалённая работа итд. Это делалось для того, чтобы R стал ниже 1 (то есть для того, чтобы каждый зараженный человек в среднем заражал меньше одного здорового человека). Таким образом, можно было уменьшить нагрузку на больницы и мед. персонал, возобновить занятия в школах и университетах итд. Теперь же, коридор возможностей может значительно сузиться. Ведь чем выше общее количество заражений, тем больше будет расти и заразность R. Мы получаем опасность практически неконтролируемого экспоненциального роста. И чем больше будет этот рост, тем больше будет количество смертей.
Если вспомнить модель „швейцарского сыра“ (меры по ограничению количества заражений), то в данной аналогии можно представить уменьшение количество дырочек в сыре.
Одновременно, с началом вакцинированная каждая смерть может быть потенциально предотвратимой. Возникает острая необходимость предотвратить резкое числа заболевших, а значит и числа дополнительных новых смертей за короткий период времени. Кроме того, такое увеличение количества заболевших приведёт к тому, что для достижения стадного иммунитета потребуется вакцинация большего числа людей.

На данный момент мы имеем дело с новыми данными, которые еще только предстоит проверить. Для получения более конкретных и проверенных данных потребуется время. В итоге, новый штамм может оказаться и значительно менее опасным, но в данном случае всё–таки применима пословица: надейся на лучшее и готовься к худшему. Именно такую тактику и применяют многие страны на данный момент, вводя новые ограничения. Ведь именно от того, как население будет реагировать в ближайшее время и зависит дальнейшее развитие событий. Предотвратить нежелательные последствия гораздо проще в начале и практически невозможно в середине и в конце.

Источники:

https://cmmid.github.io/topics/covid19/reports/uk–novel–variant/2020_12_31_Transmissibility_and_severity_of_VOC_202012_01_in_England_update_1.pdf

https://www.imperial.ac.uk/media/imperial–college/medicine/mrc–gida/2020–12–31–COVID19–Report–42–Preprint–VOC.pdf

Написал deer00hunter на coronavirus.d3.ru / комментировать

Взято отсюда